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进行细胞鉴定的根本原由-细胞错误识别被污染的危害及现状

作者:美德华生 发布时间:2023-05-18 11:10:32点击:250

2009年Nature号召建立细胞STR数据库、2010年IJC(Int J Cancer)期刊开始要求作者提供细胞鉴定报告、2011年ATCC的标准发展组织 (Standards Development Organization, SDO) 颁布了ASN-0002标准《Authentication of Human Cell Lines: Standardization of STR Profiling》、2012年国际细胞系认证委员会 (International Cell Line Authentication Committee, ICLAC) 正式建立……

      细胞错误识别/被污染的危害

      尽管学术界一直在努力,但研究人员仍在有意或无意中发表着使用错误识别/被污染细胞而写成的论文。

      自Stanley Gartler 1967年发现HEp-2、KB等细胞被HELA污染到现在,50多年中SCI期刊仍然会收到众多以HEp-2作为喉癌细胞模型的论文手稿。2019年,Philippe Gorphe的文献报道,从1954年到2018年1月,多达1036篇HEp-2相关的论文被发表在SCI期刊;他还指出在过去三十年间,HEp-2被当作喉癌细胞而写成的论文,其数量一直在增加。2017年,Horbach和Halffman指出,有大约32755篇使用错误识别/被污染细胞的论文被发表;另外,他们评估约有50万篇其他论文引用了这32755篇“primary contaminated literatures”。以上这32755篇论文,是Horbach和Halffman通过在论文题目、概述摘要及关键词搜索细胞名称而确定的。这种方法存在很大局限性和不准确性。因此,32755篇论文可能仅仅是错误识别/被污染细胞相关论文的冰山一角。

      为量化错误识别/被污染细胞所造成的损失和影响,Korch和Capes-Davis试图评估使用细胞HEp-2和Intestine 407(均被hela污染)发表论文后的经济方面的损失;他们得出结果:发表9894篇HEp-2和Intestine 407相关论文的花费高达9.9亿美金。如果按照ICLAC的Register of Misidentified Cell Lines最新登记的535株细胞来估算,使用错误识别/被污染细胞造成的资金消耗可能高达几十亿美金。单是经济损失已经相当严重,可以预见,包括资金在内的各方面的全部损失得有多么惊人!

      更为重要的是,使用错误识别/被污染细胞会导致实验结果不正确、影响研究结论的有效性,这会影响生物药的研发、疾病治疗机制的研究。在医学研究中使用错误识别/被污染细胞,还可能会对实验中的人类受试者产生潜在伤害。

      细胞错误识别/被污染的现状

      以上只是集中关注已知的错误识别/被污染细胞带来的影响。然而,细胞之间的交叉污染始终存在,它会发生在任何细胞培养实验室,并通常不易被发现。德国微生物和细胞培养物保藏中心 ( German Collection of Microorganisms and CellCulture, DSMZ) 对从1990年到2014年、来自23个国家290个实验室的848株白血病-淋巴瘤细胞进行了一项回顾性分型,结果显示:使用原始来源的细胞(如原代细胞或从权威细胞库获取的细胞),交叉污染的几率会从15%降到6%;而二次来源的细胞(如实验室间交换的细胞)发生交叉污染的几率高达14%-18%。这也就表明,实验室间交换的细胞大约有1/6是交叉污染的细胞株。


      2015年,中国典型培养物保藏中心(China Center for Type Culture Collection, CCTCC)通过对国内113个单位来源的380株细胞进行STR分型,研究发现有25%的细胞是错误识别/被污染的,这为国内的科研圈敲响了警钟。另外,他们发现85.5%(59/69)的国内建系的细胞株都是错误识别的/被污染的,这其中包括30株不同的细胞株或完全被hela污染或是hela与其他未知细胞的混合细胞(如SMMC7721、BEL-7402、BEL-7404、QGY-7703、L-02(HL7702)、SGC-7901、BGC-823、CNE1、CNE2等。

      2017年的另外两篇文章,则进一步证实了国内细胞错误识别/被污染的严重情况。CCTCC最近的研究指出,2019年中国国内细胞株的错误识别/被污染率为24.1%,相较之前的糟糕状况已经开始改善。但是,这种改善仅是集中在从公司实验室收集的细胞株样本,而从医院收集到的细胞株发生错误识别/被污染的仍有45%。