DNA条形码分子鉴定

DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术，是传统形态鉴别方法的有效补充。由于不同物种的DNA序列是由腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）、胸腺嘧啶（T）四种碱基以不同顺序排列组成，因此对某一特定DNA片段序列进行分析即能够区分不同物种。 

DNA条形码分子鉴定常用方法和相关信息

1、ITS2

ITS（internal transcribed spacer of nuclear ribosomal DNA）为内转录间隔区，是核糖体RNA（rRNA）基因非转录区的一部分。ITS位于18S rRNA基因和28S rRNA基因之间,中部被5.8S rRNA基因一分为二，即ITS1(the first internal transcribed spacer)区和ITS2(the second internal transcribed spacer)区。5.8S、18S和28S进化速率较慢，常用于探讨科级和科级以上等级的系统发育问题。而间隔区ITS(包括ITS1和ITS2)进化速率较快，一般用于研究属间、种间甚至居群间等较低分类等级的系统关系。

2、psbA-trnH

psbA-trnH基因间区是位于叶绿体基因psbA基因和trnH基因之间的一段非编码区，该间区进化速率较快，常用于植物属间、种间的系统发育研究。

3、COI

COI为线粒体基因组的蛋白质编码基因，全称为细胞色素c氧化酶亚基I (cytochrome c oxidase subunit I)，由于该基因进化速率较快，常用于分析亲缘关系密切的种、亚种及地理种群之间的系统关系。

4、BLAST

Basic Local Alignment Search Tool，即基于局部序列比对，并对数据库进行快速搜索的工具，其特点是仅搜索序列之间高度相似区域，精确且快速，是目前应用最广泛的序列相似性搜索工具之一。

5、序列相似性

指序列比对过程中查询序列和目标序列之间相同或相似核苷酸或氨基酸残基占全部比对核苷酸或氨基酸残基的百分比。