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二代测序技术(NGS)简介

作者:美德华生 发布时间:2023-05-14 15:22:24点击:303

一、NGS技术概况

随着人类对疾病认识更加深入、技术的不断发展与完善、相关应用指南与规范的逐步出台等,基因组学科技成果将能够更好地服务于精准医学实践。

精准医学是根据每一位患者的特点来调整医学治疗措施的新型医学概念和医疗模式。目前,NGS在国内外已经开始用于产前检测、单基因疾病筛查或诊断、癌症个体化治疗、药物基因组学检测等方面。NGS不仅是基因组学的重要研究手段和工具,也是驱动精准医学愿景得以实现的技术因素之一。精准医学的实现离不开NGS的支持。

NGS的应用面十分广泛,在无创产前诊断、肿瘤临床诊断、遗传性疾病检测等众多实践中都发挥着积极的作用。在无创产前诊断中采用基因检测技术(NIPS)是目前最敏感的检测技术手段,同时也能够在不同年龄人群中替代传统的三体综合征筛查技术:在肿瘤临床诊断中的“液体活检”技术有可能颠覆传统的癌症治疗方案:在遗传性疾病检测中对基因的有效检测中一方面确定致病突变并精确诊断,同时指导优生优育,避免将致病基因遗传给下一代。

NGS的应用还体现在很多方面,比如精准用药的实施可以避免药物无效使用,降低了药物毒副作用也提高了治疗效果:精准预防是通用对多个疾病基因的临床测序,可以有效预防各类疾病的产生:在科研领域也起到了很大的作用和影响,如微生物全基因组测序、寻找微卫星标记、线粒体DNA测序、靶向重测序等等。

未来的NGS将会更加科学与完善,通过NGS带来的精准医学模式的普及面也会越来越广。

二、NGS技术应用范围

1.遗传病筛查 NGS对于新生儿孟德尔式遗传病筛查项目(孟德尔遗传病)很有帮助。临床医生会根据表型与基因型的关系,进行单基因遗传检测,以此来明确诊断。孟德尔式遗传病的遗传方式非常复杂,同一种表型可能是由多个基因来决定的,其中可能有目前尚未被发现的基因。在这种情况下单基因检测就显得无能为力了,NGS解决起这种问题,能以极快的速度搞定。

2.产前诊断 在产前诊断方面,以NGS为依托的创新检测手段也彻底改变传统的诊疗模式。 无创DNA产前检测手段,能够诊21三体综合症。只需要抽取孕妇一点血液,检测其中微量的胎儿21号染色体就够了。这种非侵入式的产前检测手段,以及类似的检测13三体或者18三体综合症的检测手段都有非常高的敏感度和特异性,一定能够在产前检查领域里找到自己的位置。

NGS作为一种检测手段,主要应用于遗传病,主要的技术方案是靶向区域测序、全外显子测序、全基因组测序和线粒体DNA测序。针对某些临床证据或者药物作用靶点/耐药位点的特定热点。另外还有基于胎儿游离DNA的NIPT也是NGS在转化医学中非常经典的应用例子。随着技术的成熟,NGS也开始应用于肿瘤游离DNA的检测,HLA的分型,病原体检测,转录组测序,以及甲基化测序。但是这些领域的应用,特别是对ctDNA的NGS应用千肿瘤早筛,学界仍存在相忧,

三、NGS检测的主要目的

全外显子测序通常用于患者以及患者的双亲做家系检测以增强检测准确性。检测的主要目的是:

1.明确遗传病种类;

2.对患者近亲的检测:

3.对患者近亲致病的排除

4.风险评估;

5.生殖风险评估;

6.产前检测。

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