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人源细胞STR分型检测图谱

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参考:

1. 根据国际细胞鉴定委员会(ICLAC)制定的细胞STR鉴定标准,细胞系的匹配度≥80% 时,认为它们具有相关性,即衍生于共同的祖先细胞;匹配度在55% 至 80% 之间,需要进一步验证相关性;小于55%,表明两者不具有相关性。

2. 因数据库有的细胞只有9个位点(8个STR+1个性别位点)的参考数据,故比对时,有的结果是8个STR位点比对;如有更多位点的STR参比数据,参考新版细胞STR鉴定标准,则采用更多位点的参比数据比对结果。

3. 图谱标注分型的有效峰为真实的PCR条带;未标注分型结果的小峰和非特异性条带在计算中忽略不计。

4. 本匹配度计算默认依照Cellosaurus计算规则(2*相同等位基因数/待检样本等位基因数与参比数据等位基因数总和),若有个性化需求委托方可提前提出。

5. 委托方细胞样本若为干细胞,免疫细胞,原代细胞等细胞,且未提交至公开数据库,STR数据优先与自身donor样本或早期样本STR数据比对。如实验室有其它细胞系培养时,也可与数据库比对,排除是否被已知STR数据的细胞系污染。

6. STR数据比对默认Cellosaurus数据库,该数据库是目前最权威最全面的细胞系STR数据库比对来源,集合了ATCC,DSMZ,JCRB、ECACC、COG、CBA、KCLB等所有数据库或文献发布的人源和小鼠细胞STR数据,若有其它个性比对数据要求需提前注明被检样本的STR数据比对来源。

7. 基因座分型只有一个数字,表示该基因座为纯合子;基因座有两个不同数字,表示该基因座为杂合子。若有多个不同数字,表示该基因座有多等位基因,提示非正常二倍体细胞或该细胞被交叉污染。